Di Dunia Oz, film dimulai dengan kematian Elphaba, yang disambut dengan perayaan oleh warga Munchkinland. Glinda, si Penyihir Baik, menceritakan kisah persahabatan mereka yang tidak biasa. Elphaba, seorang gadis dengan kulit hijau dan kemampuan sihir, menghadapi penolakan sejak lahir. Di Shiz University, ia bertemu Galinda, gadis populer yang awalnya meremehkannya. Meskipun berbeda, mereka mulai menjalin persahabatan yang mendalam. Setelah mengetahui konspirasi yang menindas makhluk berbicara di Oz, Elphaba berharap pada Wizard of Oz, yang ternyata adalah pria biasa. Kekecewaan membuat Elphaba melarikan diri, dipandang sebagai penyihir jahat oleh Madame Morrible, mantan dekan universitas.